本镇属于亚热带湿润气候区，年均绛水量1075.7毫米，蒸发量1450.5毫米；年平均气温15.5℃，绝对湿度15.8毫巴，相对温度80.6%；全年无霜期222天；本区降水充沛，多集中在5~9月份；11月至次年1月降水较少，这枯水期。响洪甸水库位于本镇西南方10余公里处，库容为27亿立方米，是本地区最大的地表水水源。
本镇属于大别山前的江淮丘陵区,地形起伏,岗陇沟谷相间,岗顶标高在80~100米，谷底标高在61~82米，地形高差约20米；地热呈西南高，东北低走向，整个镇城呈南北带状分布。南端及东西两侧为山地，中间为地势较低的湾畈地区。地貌类型属构造——剥蚀类型中的丘陵区，分布于大别山外缘，绝对高度70~200米，山脊线不连续，山顶浑圆坡角不大，20°~30°坡地植被茂盛，局部岩层受硅化地段山顶呈尖顶，植被发育不良，常构成光秃的山坡和陡峻的峭壁，有断层陡崖分布，切割较甚，“V”谷发育。低丘则发育不良，丘体由侏罗系火山碎岩及砂岩，砂砾岩组成。
本区地层属杨子地层区，大别山地层分区中的六安地层小区，山露地层有震旦系佛子岭群，石炭——二叠系“梅山群”，中生界侏罗系凤凰台组，白大畈组及新生界第三系，第四系地层。
石婆店镇在清初，曾是荆山县城所在地，历史悠久；在土地革命时期，这里是红四方面军的活动地；解放战争时期，这里又是大别山根据地的重要组成部分；1992年实行撤区并乡，将原有的石婆店镇、骆家庵和黄涧河三乡合并，成立新的石婆店乡；1998年5月实行乡改镇制，建立石婆店镇。.