重庆市医学会成立于1940年4月（曾用名中华医学会重庆分会、重庆医学会，1997年正式更名为“重庆市医学会”），是由全市医疗卫生、医学教育、医学科研机构，以及医药生产企业和医学科学技术工作者自愿结成并依法注册登记的地方性、学术性、非营利性社会组织，在中国共产党的领导下，发挥党和政府联系医学科学技术工作者的桥梁和纽带作用，是发展我市医学科学技术和卫生健康事业的重要社会力量。重庆市医学会的最高权力机构是会员代表大会，每届5年，理事会是会员代表大会的执行机构，在会员代表大会闭会期间领导本会日常工作，对会员代表大会负责；设立常务理事会，在理事会闭会期间行使相应职权，对理事会负责。本会设立监事会，监事会任期与理事会任期相同。重庆市医学会自成立以来，始终坚持中国共产党的全面领导和办会宗旨，按党章规定设立党组织，开展党的活动。遵守国家宪法、法律、法规和政策，遵守社会道德风尚，践行社会主义核心价值观，团结医学科技工作者，崇尚医学道德，弘扬社会正气，坚持民主办会原则，充分发扬学术民主，传播医学科学知识。遵循公开、公平、公正、及时、便民的原则，坚持实事求是的科学态度，依法组织医学鉴定工作。依法维护医学科学技术工作者的合法权益，为医学科学技术工作者服务。截止2023年12月，学会有4个工作委员会，81个专科分会，166家单位会员，1.5余万名个人会员，涵盖了全市卫生健康行业各个专业的骨干人才，是重庆地区历史最悠久、影响最广泛、作用最显著的医学学术组织。